有料ではありますがTeXPadはMac利用者にとってはとても便利なソフトウェアだと思います．
日本語を利用する際には，デフォルトではplatex->dvipdfmxであればコンパイルすることが可能です．一方で，uplatexなどを用いてコンパイルしたい場合には，独自のBuild Scriptを作成する必要があります．uplatexとupbibtexを用いてコンパイルするBuild Scriptを作っても良いのですが，latexmkを用いてコンパイルできるようにすれば，カスタマイズが容易になり非常に便利です．
TeXPad用Build Script (latexmk.tpbuild)
元々TeXPadにはlatexmk用のBuild Scriptがありますが，日本語対応ではありません．そこでlatexmk用のBuild Scriptを作成しました．コンパイルする際にbackupファイルを作成することとと，コンパイルの際に大量に出てくる中間ファイルを.texpadtmpフォルダに移動する仕組みを実装しています．中間ファイルを移動する仕組みは，一度すべてのファイルを.texpadtmpフォルダに移動した後にtexファイルだけ戻してくる方法をとっています．
#!/bin/bash
# texのbackup(.bk)を作成
cp "$TEXPAD_ROOTFILE" "$TEXPAD_ROOTFILE_NO_EXT".bk
# texのコンパイル
latexmk -gg -pdfdvi "$TEXPAD_ROOTFILE"
# 中間ファイルを.texpadtmpに作成
mkdir .texpadtmp 2>/dev/null
mv -f "$TEXPAD_ROOTFILE_NO_EXT".* .texpadtmp/ 2>/dev/null
fname=$(basename "$TEXPAD_ROOTFILE_NO_EXT") 2>/dev/null
mv -f ./.texpadtmp/"$fname".{tex,bib} ./ 2>/dev/null
latexmkの設定ファイル (.latexmkrc)
latexmkの設定ファイルは，ホームディレクトリに.latexmkrcとして保存するのが1つの方法です．僕はuplatex, upbibitexもしくはbiberを用いる設定ファイルとして，以下のものを用いています．PDFはSkim.appを利用してプレビューするように設定していますが，TeXPadではTeXPadのviewerを使いたいので，その点はlatexmkを実行する際に生成されたPDFを表示しない用にして対応しています．
#!/usr/bin/env perl
$latex = 'uplatex %O -synctex=1 -halt-on-error %S';
$latex_silent = 'uplatex %O -synctex=1 -halt-on-error -interaction=batchmode %S';
$biber = 'biber %O --bblencoding=utf8 -u -U --output_safechars %B';
$bibtex = 'upbibtex %O %B';
$makeindex = 'upmendex %O -o %D %S';
$dvipdf = 'dvipdfmx %O -o %D %S';
$pdf_mode = 3;
$pvc_view_file_via_temporary = 0;
$pdf_previewer = 'open -ga /Applications/Skim.app';
